Le machiavélique Capitaine Fisheye menace la paix dans le monde: il projette de lancer des torpilles dans la mer et de créer un tsunami géant pour détruire la planète! Les Top Agents vont faire leur possible pour arrêter ce plan diabolique et ils peuvent compter sur leur jeune recrue, l'agent Agile. Il démarre sa mission sur les chapeaux de roue avec l'agent Jet, et ce duo d'agents secrets n'est pas au bout de ses surprises! Les Top Agents pourront-ils sauver le monde?